由于客群基础差异，大型商业银行存款基数大，资产端的信贷需求难以覆盖负债端的存款。部分中小银行信贷业务需求可观，但存款受限。同业存单的发展，促进了银行间的流动性，盘活了银行的存款等负债。
汇改后，央行投放基础货币的方式由外汇占款转变为 MLF、SLF、逆回购等货币政策工具，而中小银行因缺少合格抵押品很难参与其中。同业存单的出现帮助他们突破地域与资金来源的限制，实现资产高速扩张。